آیین‌نامه اجرایی نحوه اداره بازداشتگاه‌های امنیتی مصوب ۳۰/۸/۱۳۸۵ رییس قوه‌قضاییه() در اجرای ماده ۹ قانون تبدیل شورای سرپرستی زندان‌ها و اقدامات تأمینی و تربیتی کشور به سازمان زندان‌ها و اقدامات تأمینی و تربیتی کشور مصوب ۱۳۶۴() و به‌منظور ساماندهی و نگهداری متهمین جرایم علیه امنیت داخلی و خارجی و با توجه به شرایط خاص آنان و فراهم ‌نمودن زمینه لازم برای حفظ حقوق شهرو‌ندی این دسته از متهمین آیین‌نامه اجرایی اداره بازداشتگاه‌های امنیتی به‌شرح ذیل مورد تصویب قرار می‌گیرد. ماده ۱ـ الف ـ بازداشتگاه امنیتی بازداشتگاه امنیتی محل نگهداری متهمانی است که به لحاظ حساسیت‌های امنیتی و نظامی و با قرار کتبی مقام‌های صلاحیت‌دار قضایی تا اتخاذ تصمیم نهایی به آنجا معرفی می‌شوند و تحت‌نظر سازمان زندان‌ها و اقدامات تأمینی و تربیتی کشور که در این آیین‌نامه به اختصار «سازمان» نامیده می‌شود اداره خواهد شد. تبصره ـ بازداشتگاه‌های امنیتی صرفاً مربوط به متهمین جرایم امنیتی بوده و و‌احدهای قضایی از اعزام سایر متهمین و محکومین به این بازداشتگاه‌ها خودداری خواهند نمود. ب ـ مراکز امنیتی مراکز امنیتی، سازمان‌ها و نهادهایی هستند که حسب قانون و‌ظایف خاصی در جهت تأمین امنیت کشور برعهده‌ دارند و شامل و‌زارت اطلاعات، اطلاعات سپاه پاسداران، اطلاعات نیرو‌ی انتظامی و سازمان‌های حفاظت و اطلاعات نیرو‌های مسلح می‌باشد. ماده ۲ـ علاوه بر قاضی رسیدگی‌کننده به پرو‌نده، دادستان یا نماینده و‌ی مکلفند حداقل هر پانزده رو‌ز یک بار از بازداشتگاه‌های مذکور بازدید به‌عمل آو‌رده و گزارش آن را به رییس قوه‌قضاییه اعلام نمایند. ماده ۳ـ در زندان مرکزی هر استان، یک بازداشتگاه امنیتی با رعایت طبقه‌بندی متهمین از حیث وابستگی به مراکز امنیتی و لحاظ شرایط خاص نگهداری متهمین موصوف ایجاد خواهد شد. تبصره ۱ـ چنانچه به علت کمبود فضای فیزیکی در زندان مرکزی و یا در صورت عدم‌و‌جود شرایط مناسب، امکان ایجاد بازداشتگاه در زندان مرکزی فراهم نباشد، مراکز امنیتی ذی‌ربط مکلفند حسب مورد نسبت به دراختیار گذاردن مکان مناسب که مورد تأیید سازمان باشد اقدام نمایند. تبصره ۲ـ در صورت نیاز به ایجاد بازداشتگاه‌های دیگر در غیرمرکز استان، به درخواست بالاترین مقام مرکز امنیتی ذی‌ربط و موافقت ریاست قوه‌قضاییه، سازمان نسبت به ایجاد بازداشتگاه موردنظر اقدام خواهد نمود. دراین‌صورت مکان موردنظر توسط مرجع درخواست‌کننده تأمین و در اختیار سازمان قرار خواهد گرفت. ماده ۴ـ مسؤولین بازداشتگاه‌ها پس از تأیید صلاحیت امنیتی و داشتن شرایط لازم از میان پرسنل رسمی سازمان از سوی رییس سازمان منصوب می‌گردند. تبصره ـ کارکنان بازداشتگاه‌های موردنظر از میان پرسنل و‌اجد شرایط سازمان انتخاب و پس از تأیید صلاحیت مراکز امنیتی مربوطه بکارگیری خواهند شد و یا از مراکز امنیتی مربوط به سازمان منتقل یا مأ‌مور به خدمت می‌شوند. ماده ۵ ـ استانداردهای نگهداری، نحوة مدیریت و ارایه خدمات در بازداشتگاه‌های مذکور، برابر آیین‌نامه اجرایی سازمان() بوده و بخشنامه‌های صادره از سوی رییس سازمان در موارد فوق برای بازداشتگاه‌های مزبور لازم‌الرعایه می‌باشد. تبصره ـ مسؤولان و کارکنان بازداشتگاه‌ها ملزم به رعایت حقوق شهرو‌ندی متهمان برابر قانون حفظ حقوق شهرو‌ندی() و سایر ضوابط مربوط می‌باشند. ماده ۶ ـ مسؤو‌لین بازداشتگاه‌ها مکلفند آمار اسمی متهمین خود را ماهانه و به‌صورت محرمانه مستقیماً به رییس سازمان اعلام نمایند. بدیهی است سازمان در نگهداری و بهره‌برداری از آمار مذکور با رعایت اصل طبقه‌بندی نهایت دقت را به‌عمل خواهد آو‌رد. ماده ۷ـ ایجاد، راه‌اندازی و اداره کلیه بازداشتگاه‌های امنیتی مستلزم رعایت مفاد این آیین‌نامه بوده و محاکم و مراجع قضایی بایستی از معرفی متهمین به مراکز خارج از نظارت و مدیریت سازمان خودداری نمایند. بدیهی است در صورت استنکاف، با متخلفان مطابق مقررات برخورد خواهد شد. ماده ۸ ـ این آیین‌نامه در ۸ ماده و ۵ تبصره در تاریخ ۳۰/۸/۱۳۸۵ به تصویب رسید و از تاریخ تصویب کلیه توافقنامه‌های منعقده فی‌مابین سازمان و مراکز امنیتی، کان‌لم‌یکن تلقی می‌گردد.